Shranjevanje razkužil zahteva pozornost na več vidikov. Prvič, razkužila hranite na suhem, hladnem in dobro{1}}prezračenem mestu. Visoke temperature in vlaga lahko povzročijo, da se razkužila razgradijo ali pokvarijo, kar zmanjša njihovo učinkovitost. Pri visokih temperaturah so lahko nekatere sestavine razkužila podvržene kemičnim reakcijam, kar bistveno zmanjša njegov baktericidni učinek; medtem ko lahko vlaga povzroči, da razkužilo absorbira vlago, kar vpliva na njegovo stabilnost in učinkovitost. Drugič, izogibati se je treba neposredni sončni svetlobi. Ultravijolični žarki na soncu lahko poškodujejo sestavine razkužila in pospešijo proces njegovega kvarjenja. Hkrati je treba upoštevati zahteve glede shranjevanja razkužil, paziti na rok uporabnosti in se izogibati uporabi razkužil s pretečenim rokom uporabnosti. Razkužilom, ki jim je potekel rok uporabnosti, se je morda spremenilo delovanje, tako da niso dosegla pričakovanega baktericidnega učinka in imajo lahko celo škodljive učinke na sistem. Poleg tega so za nekatera razkužila s posebnimi lastnostmi, kot so vnetljiva, eksplozivna ali strupena razkužila, potrebni posebni ukrepi za shranjevanje, da se zagotovi varnost skladiščnega okolja in preprečijo nesreče. Med skladiščenjem je treba tudi razkužila shranjevati ločeno od drugih predmetov, da preprečite medsebojno motenje.
